比丘们为舍利弗就要涅槃而难过，舍利弗说：“诸位贤者且莫忧愁，变化的事物，要使它不变这是办不到的。如来是金刚之身，不久也要涅槃，更何况是我呢？”说完回到精舍收起衣钵，出了竹园向东方乞食，回到了故乡萩林村。
舍利弗平常爱徒如子，住在祇园时，一位弟子患病，服药后想吃粥。他亲自到瓦师家乞求瓦钵。瓦师不愿意施舍，说：“怎样布施才能既得到超过真实品德的好名声，又不必破费一分钱呢？”舍利弗说：“不吃肉者给他肉，修离欲梵行者给他女人，不坐大床者给他大床，临行者给他住处，这样施舍不花钱，还有好名誉，美名四处流传，而你并未付出什么！”
瓦师说：“你说得真好，一个瓦钵不值得施舍，我要施舍就舍给你一百个，其他东西也不是不能给你！”
舍利弗说：“即便是欲界天想要布施瓦钵，也要对佛法有信仰才可以，而你却没有信仰！”说完默然而出，未接受他的虚假布施。现在自己“身遇疾病极为苦痛”，身边有徒弟纯陀沙弥照顾。
舍利弗比佛的年龄可能略高一些，早在祇园的一次夏坐后，他刚向佛辞行，要去人间游化，就有人向佛说他坏话，称：“舍利弗与比丘们吵完架，不忏悔，就离去了！”佛派人将他召回，询问有无此事。
舍利弗清楚佛有知人之明，想以不辩为解脱，就说：“佛了解我！”佛说：“但是大众各怀狐疑，你现在可以当众为自己申辩，证明自己的清白！”
舍利弗说：“我从出生到现在快八十岁了，经常自我反省，未曾有过杀生乃至妄语，即使在玩耍时也不说假话，或者挑拨离间，不专心的时候可能会有这种行为，而我现在心意清净，哪里会与梵行人斗争呢？”那时候，舍利弗就已经年近八十了，现在又不知过了几年。
舍利弗涅槃后，纯陀沙弥收取尊者舍利，挑担衣钵来到竹园，先去见了阿难，说：“我师父已经灭度了，我想把他的舍利和衣钵献给世尊！”
阿难带他向佛禀报，说：“纯陀沙弥对我说‘和尚舍利弗涅槃了……’，我听了全身像散了架，头脑嗡嗡的分不清东西南北，连话都不会说了！”
佛问阿难：“舍利弗比丘是用戒身、定身、慧身、解脱身、解脱知见身取涅槃的吗，是持四念处、四正断、四如意足、五根、五力、七觉支、八正道而取涅槃的吗？”
阿难说：“都不是！虽然涅槃清净，无有一法可得，既不是持所受戒的肉身入涅槃，也不是带着三十七道品法而灭度，但是舍利弗持戒多闻，善于为大众说法，而且诲人不倦，我怀念舍利弗对大众恩情深厚，利益实在是太多了，他入涅槃是对正法，对受法者的一大损失，我为此而感到忧愁苦恼！”
佛说：“阿难不必难过，无常之物，想使它永恒不变，这是不可能的，从毗婆尸佛乃至宝藏、锭［dēng］光等过去诸佛，如今不是全都灭度了吗？同样，辟支佛审谛、高称、远闻、尼磋、优般尼磋、伽罗，优般伽罗，那么多辟支佛不是也都灭度了吗？过去贤劫初，大国圣王名曰善悦、摩诃提婆，像这样的转轮圣王今天又在哪里呢，岂不是全都磨灭了吗？有生就有死，一切行无常，生者当有死，不生不覆灭，此灭最第一！”
佛说过：“人命极少要至后世，生无不死，今是正说！”没有长生不死的人和永不涅槃的佛，这才是正确说法。过去佛全都灭度了，从来没有永远不死的佛。虽然佛说最长可以驻寿一劫，但是“释迦文佛终不住一劫，释迦文佛不久在世！”释尊如此，一切诸佛无不如此。可爱的人事物都不能常保，这是佛的教诲。
佛对阿难说：“你把舍利弗的遗骨拿给我！”阿难将遗骨交到佛的手上。
佛手执舍利对比丘们说：“你们看，这是舍利弗比丘的遗骨。舍利弗有甚深广大、如实不虚的智慧，他机智过人，辩才无碍。他少欲知足，乐居闲静。他高才勇猛，所作不乱。他修行慈忍，除去恶念，性格柔和，不喜斗争。他有恒心有毅力，精进勤修正定，常修慧观，专念解脱，是心解脱、智慧解脱者，已经进入无余涅槃，就像大树没有枝叶那样干净洒脱。然而，今日如来失去了舍利弗，就像大树失去了最大的树枝！”
舍利弗涅槃以后，大目揵连以神足力来到佛前，再三请求灭度，佛始终沉默不语。佛在此地也曾九死一生，如今神通第一的大弟子也将殒没于此，痛失左膀右臂，情何以堪，要去终须去，再三留不住，还能说什么呢！
目连辞别世尊，出了王舍城，回到出生地，在萩林村露地敷座，从初禅渐次入有想无想处，从有想无想处起入火光三昧，从火光三昧起入水光三昧，从水光三昧起入灭尽定；再从灭尽定起渐次回到初禅；从初禅飞在空中坐卧经行，身上出火身下出水，或身下出火身上出水，作十八种神变后落地趺坐，乃至在第四禅契入无余涅槃。
那时，大地发生了强烈的震动，村子周围四十里内，诸天充满虚空，以香花音乐歌舞等供养大目揵连。地上有众多比丘手持各种香花，撒在尊者的遗体上！
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